Электрофорез жүйесі екі негізгі компоненттен тұрады: қуат көзі және электрофорез камерасы. Қуат көзі қуат береді.Бұл жағдайда «қуат» электр болып табылады.Қуат көзінен келетін электр энергиясы бір бағытта электрофорез камерасының бір шетінен екінші шетіне өтеді.Камераның катоды мен аноды қарама-қарсы зарядталған бөлшектерді тартады.
Электрофорез камерасының ішінде науа, дәлірек айтқанда, құю науасы бар.Құю науасы келесі бөліктерден тұрады: құю науаның түбіне түсетін шыны пластина.Гель құю науасында ұсталады.«Тарақ» өз атына ұқсайды. Тарақ құйма науаның бүйіріндегі ойықтарға орналастырылған. Ол ыстық, еріген гельді құймас бұрын ұяларға салынады.Гель қатқаннан кейін тарақ алынады.Тарақтың «тістері» гельде біз «ұңғыма» деп атайтын шағын тесіктерді қалдырады.Ұңғымалар ыстық, еріген гель тарақтың тістерінің айналасында қатып қалғанда жасалады.Гель салқындағаннан кейін тарақ шұңқырларды қалдырғаннан кейін шығарылады.Ұңғымалар сынағыңыз келетін бөлшектерді қоюға арналған орынды қамтамасыз етеді.Бөлшектерді жүктеген кезде адам гельді бұзбау үшін өте мұқият болуы керек.Гельді жару немесе бұзу нәтижелерге әсер етуі мүмкін.