DYCP-31DN жүйесі – көлденең электрофорез жүйесі. Көлденең гельдік электрофорезде гель көлденең бағытта құйылады және гель қорапшасының ішінде жұмыс істейтін буферге батырылады. Гель қорапшасы екі бөлікке бөлінген, екеуін ажырататын агарозды гель бар. Бұрын айтылғандай, анод бір ұшында, ал катод екінші жағында орналасқан. Иондық жұмыс буфері ток қолданылған кезде заряд градиентін жасауға мүмкіндік береді. Сонымен қатар, буфер гельді салқындату үшін қызмет етеді, ол зарядты қолданған кезде қызады. рН градиентінің пайда болуын болдырмау үшін жұмыс істейтін буфер жиі қайта айналымға түседі. Қолданылатын тарақтардың әртүрлі өлшемдері бар. Әртүрлі тарақтар бұл көлденең электрофорез жүйесін кез келген агарозды гельді қолдануға, соның ішінде суасты электрофорезіне, шағын мөлшердегі үлгілермен жылдам электрофорезге, ДНҚ, суасты электрофорезіне, ДНҚ-ны анықтауға, бөлуге және дайындауға және молекулалық салмақты өлшеу.
Электрофорез кезінде құю науасында гель түзіледі. Науада сынағыңыз келетін бөлшектерді ұстайтын шағын «ұңғымалар» бар. Сынағыңыз келетін бөлшектері бар ерітіндінің бірнеше микролитрлері (мкл) ұңғымаларға мұқият жүктеледі. Содан кейін электрофорез камерасына электр тогын өткізетін буфер құйылады. Әрі қарай, бөлшектері бар құю науасы мұқият камераға салынып, буферге батырылады. Соңында камера жабылып, қуат көзі қосылады. Электр тогының әсерінен пайда болған анод пен катод қарама-қарсы зарядталған бөлшектерді тартады. Бөлшектер гельде қарама-қарсы зарядқа қарай баяу қозғалады. Қуат өшіріліп, гель алынып, тексеріледі.